100 aminoácidos es el límite entre un péptido y una proteína.[8][9][10][11]
Los autores difieren mucho en cuanto a dónde comienzan a usar el término proteína.[12]
Los péptidos se diferencian de las proteínas en que son más pequeños (tienen por convención menos de 10.000 o 12.000 Daltons de masa) y que las proteínas pueden estar formadas por la unión de varios polipéptidos y a veces grupos prostéticos.[5]