Físicos teóricos de la Universidad de Leiden han demostrado que la mecánica de ADN, además de la información genética en el ADN, determina quiénes somos. Helmut Schiessel y su grupo simularon muchas secuencias de ADN y encontraron una correlación entre las señales mecánicas y la forma del ADN.
Efectivamente, la degeneración del código genético (el hecho de que la práctica totalidad de aminoácidos son codificados por más de un triplete) sirve para crear un sistema de regulación génica en el que interviene la topología del ADN y su afinidad por las histonas. O sea, que los tripletes sinónimos (que codifican para el mismo aminoácido) no son exactamente equivalentes.
Estaba cantado, pero había que demostrarlo.
#7:
#4 no te pases, es un sistema de regulación génica más de los muchos que hay... Pero si, es muy interesante, al menos como para merecer portada.
#24:
#4 Es verdad que es importante pero tampoco para pasarse; la regulación epigenética también es impresionantemente compleja y fascinante a mi parecer, y al final todos los niveles sumados llevan a tener un nivel de control de la expresión génica sumamente fino. Esto, a mi parecer, viene a sumar un nivel más de complejidad que no me extraña que surja (ya se hablaba de la expresión ligada a la situación de determinados genes en el núcleo, y esto no difiere mucho) dada la enorme complejidad de la organización eucariota. La expresión génica es un mundo complejísimo del que no sabemos ni la mitad! (#19)
#44:
#6 Los tripletes sinónimos no son exactamente equivalentes. Se sabe que los tRNA no existen en la célula en la misma proporción. Eso hace que el uso de uno u otro codón sinónimo afecte a la expresión.
Efectivamente, la degeneración del código genético (el hecho de que la práctica totalidad de aminoácidos son codificados por más de un triplete) sirve para crear un sistema de regulación génica en el que interviene la topología del ADN y su afinidad por las histonas. O sea, que los tripletes sinónimos (que codifican para el mismo aminoácido) no son exactamente equivalentes.
#4 Es verdad que es importante pero tampoco para pasarse; la regulación epigenética también es impresionantemente compleja y fascinante a mi parecer, y al final todos los niveles sumados llevan a tener un nivel de control de la expresión génica sumamente fino. Esto, a mi parecer, viene a sumar un nivel más de complejidad que no me extraña que surja (ya se hablaba de la expresión ligada a la situación de determinados genes en el núcleo, y esto no difiere mucho) dada la enorme complejidad de la organización eucariota. La expresión génica es un mundo complejísimo del que no sabemos ni la mitad! (#19)
#6 Los tripletes sinónimos no son exactamente equivalentes. Se sabe que los tRNA no existen en la célula en la misma proporción. Eso hace que el uso de uno u otro codón sinónimo afecte a la expresión.
#17 la investigación en biología cada vez se basa más en bioinformatica y simulaciones y modelado. Los del laboratorio lo único que hacemos es experimentar y acabar dándoles la razón.
#51 Buena pregunta... En principio no, porque estaríamos hablando de un sistema bastante estático. Pero lo cierto es que la histona H1 está sujeta a una inestabilidad dinámica comparable a la de los microtúbulos. No tengo una respuesta ahora mismo, tendré que leerme los datos más a fondo.
¿Soy el único que viendo el paper entiende que no han demostrado nada?
Los resultados en simulaciones son eso, simulaciones, ahora deben probar que es así en tejido vivo.
De todas formas tampoco veo nada novedoso en lo que dicen, allá por el 2005 cuando empecé a estudiar estas cosas ya me decían que la geometría que haya adoptado el DNA al plegarse afecta a su expresión.
Qué extraño que dada la relevancia () los autores hayan elegido publicarlo en PLoS One en vez de en Science o Nature . Por otra parte, pensaba que ya había una segunda capa de información no codificada en el genoma: la información epigenética.
#39 Pues parece que no es así. Parece que cada posibilidad se explicita en una geometría del ADN que contiene información regulativa. Y es más: parece que se ha descubierto la forma más primitiva de regulación. Supongo que ahora todos los ARN interferentes, todas las acetilaciones y metilaciones de las histonas, y todos los otros sistemas de regulación génica tendrán que mirar a lo que han descubierto.
#6 Yo siempre había entendido la degeneración como un sistema de redundancia para reducir la posibilidad de un cambio de aminoácido por la mutación de una sola base.
#19 PLoS es un Q1, con un impacto más que aceptable, y hay bastantes autores que están publicando ahí, al ser open access. Pero sí, ese paper debería ser carne de Nature Genetics.
Esteganografía en el ADN, al final Dios nos usa para compartir fotos porno y musica con Shiva y Buda sin que los dioses del copyright se den cuenta, al final solo somos paquetes de informacion en transito.
#43 El artículo da muchas luces sobre lo que me dices: dilata y contrae los surcos mayores y menores, y por ello regula la accesibilidad de las enzimas lectoras.
#44 Lo que me estas contando es a nivel traduccional. Esto sería una regulación a nivel de transcripción y parece que utiliza una vía muy parecida a las epigenéticas tanto canónica como no canónica. Perdona mi tardanza en responderte, pero ando bastante liado.
#17 Yo quisiera, pero no entiendo ni pizca de estas cosas, pero lo poquito que he deducido es que "Por primera vez, el físico Helmut Schiessel y su grupo de investigación proporcionan una fuerte evidencia de que esta segunda capa de información existe en efecto"
es decir, que como señalas, ya se sospechaba y que no, que aún no se ha demostrado científicamente, pero que ahí andan de poder demostrarlo.
Confirmado un carajo, primero porque son simulaciones, encima de físicos, y está publicado en un journal de simulaciones físicas, si esto fuese demostrable más allá de una "correlación" estaría en la portada de Nature y Science.
#34 Nature mete últimamente muchísima morralla (y te la endiñan como contenido gratuito) casi sin corregir. Y como des con un revisor imbécil te puedes morir. El último nos dijo que el inglés no era suficientemente bueno, y estaba redactado por dos nativas. Cuando no te piden que cites al Dr. X 54 veces...
#55 El Nobel, no sé. Pero publicaciones en Nature (Immunology, y Cellular & Molecular Inmmunology) y PNAS llevo unas cuantas ya. Ni Nature es la panacea, ni PLoS One es el Teleprogramas.
#6 No deja de ser una incógnita, pues ahora queda saber de como interviene la posición (forma mecánica) para influir en las ciertas características determinadas e individuales para cada órgano.
Comentarios
due to the degeneracy of the genetic code
Me ha costado encontrarlo, porque lo suponía, pero finalmente apareció al final del todo del artículo original:
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371%2Fjournal.pone.0156905
Efectivamente, la degeneración del código genético (el hecho de que la práctica totalidad de aminoácidos son codificados por más de un triplete) sirve para crear un sistema de regulación génica en el que interviene la topología del ADN y su afinidad por las histonas. O sea, que los tripletes sinónimos (que codifican para el mismo aminoácido) no son exactamente equivalentes.
Estaba cantado, pero había que demostrarlo.
#4 no te pases, es un sistema de regulación génica más de los muchos que hay... Pero si, es muy interesante, al menos como para merecer portada.
En español: http://www.europapress.es/ciencia/laboratorio/noticia-confirma-existe-segunda-capa-informacion-adn-20160608144552.html
Son como capas de un pastel... http://www.physics.leidenuniv.nl/index.php?id=11573&news=889&type=LION&ln=EN
#2 ¡No! ¡El ADN tiene capas como las cebollas!
#4 Es verdad que es importante pero tampoco para pasarse; la regulación epigenética también es impresionantemente compleja y fascinante a mi parecer, y al final todos los niveles sumados llevan a tener un nivel de control de la expresión génica sumamente fino. Esto, a mi parecer, viene a sumar un nivel más de complejidad que no me extraña que surja (ya se hablaba de la expresión ligada a la situación de determinados genes en el núcleo, y esto no difiere mucho) dada la enorme complejidad de la organización eucariota. La expresión génica es un mundo complejísimo del que no sabemos ni la mitad! (#19)
En cuanto a noticia médica de la década (y me aventuraría a decir del siglo, dado el alcance que puede tener), yo pondría el descubrimiento de la técnica CRISPR: http://culturacientifica.com/2014/02/14/la-inminente-revolucion-de-la-ingenieria-genetica-basada-en-el-sistema-crisprcas/.
Si es cierta creo que sería la noticia médica más importante de toda la década.
#6 Los tripletes sinónimos no son exactamente equivalentes. Se sabe que los tRNA no existen en la célula en la misma proporción. Eso hace que el uso de uno u otro codón sinónimo afecte a la expresión.
https://en.wikipedia.org/wiki/Codon_usage_bias
#15
#6 Ahora le van llamar el código de dios.
#6 Degenerados everywhere
A ver si va a ser como el zumbido de Contact, que cuando enchufen los datos a un video vhs salga la cara de algun asesino o politico corrupto
#17 la investigación en biología cada vez se basa más en bioinformatica y simulaciones y modelado. Los del laboratorio lo único que hacemos es experimentar y acabar dándoles la razón.
Entonces sera super ADN
#1 metaADN
El patrocinador. Yo tengo un anti pop-ups, por lo que no puedo ver esa capa en segundo plano de información.
#13 Prefiero los planos para construir un StarGate
#51 Buena pregunta... En principio no, porque estaríamos hablando de un sistema bastante estático. Pero lo cierto es que la histona H1 está sujeta a una inestabilidad dinámica comparable a la de los microtúbulos. No tengo una respuesta ahora mismo, tendré que leerme los datos más a fondo.
#52 Muchísimas gracias.
¿Soy el único que viendo el paper entiende que no han demostrado nada?
Los resultados en simulaciones son eso, simulaciones, ahora deben probar que es así en tejido vivo.
De todas formas tampoco veo nada novedoso en lo que dicen, allá por el 2005 cuando empecé a estudiar estas cosas ya me decían que la geometría que haya adoptado el DNA al plegarse afecta a su expresión.
Qué extraño que dada la relevancia () los autores hayan elegido publicarlo en PLoS One en vez de en Science o Nature . Por otra parte, pensaba que ya había una segunda capa de información no codificada en el genoma: la información epigenética.
#22 Eso es cierto, pero hasta que la evidencia no es probada decir algo así es aventurarse mucho, por muy obvios que sean los resultados.
#6 ¡Una pista! ¡Gracias! No tengo nivel para leerme el artículo original y en la noticia no entendía en qué consistía esa segunda capa.
#50 No, era algo así como esta El virus del sida logra esquivar la técnica CRISPR
El virus del sida logra esquivar la técnica CRISPR
investigacionyciencia.es#16 Amigo mío: no te quepa la menor duda. Y probablemente tendrán razón. Debe de ser la forma de regulación más primitiva y arcaica.
#16 ni lo mentes...
#19 esa está sobre (epi) la secuencia. Esta otra estaría de algún modo entre las dos.
Como ya adelantó Iker Jimenez.
#28 PLoS One acepta cualquier artículo que sea sólido, independientemente de su interés. Por tanto, si tienes un paper potente no lo mandas ahí.
#15 se podrà echar ADN a la tortilla?
#39 Pues parece que no es así. Parece que cada posibilidad se explicita en una geometría del ADN que contiene información regulativa. Y es más: parece que se ha descubierto la forma más primitiva de regulación. Supongo que ahora todos los ARN interferentes, todas las acetilaciones y metilaciones de las histonas, y todos los otros sistemas de regulación génica tendrán que mirar a lo que han descubierto.
#6 Yo siempre había entendido la degeneración como un sistema de redundancia para reducir la posibilidad de un cambio de aminoácido por la mutación de una sola base.
#19 PLoS es un Q1, con un impacto más que aceptable, y hay bastantes autores que están publicando ahí, al ser open access. Pero sí, ese paper debería ser carne de Nature Genetics.
Esteganografía en el ADN, al final Dios nos usa para compartir fotos porno y musica con Shiva y Buda sin que los dioses del copyright se den cuenta, al final solo somos paquetes de informacion en transito.
#44 Pues probablemente este hallazgo da cuenta del porqué de esa estequiometría.
#43 El artículo da muchas luces sobre lo que me dices: dilata y contrae los surcos mayores y menores, y por ello regula la accesibilidad de las enzimas lectoras.
#6 Pregunta de lego absoluto en la materia: ¿Tú crees que Roger Penrose debería estar frotándose las manos ante esta noticia?
#36 ¿No será esto otro Los virus gigantes tienen un sistema "inmune" parecido a la técnica CRISPR (ING)
Los virus gigantes tienen un sistema "inmune&...
nature.comLa relación entre SIDA y Crispr es diferente: http://www.omicrono.com/2016/03/eliminar-vih-crispr-cas9/
#44 Lo que me estas contando es a nivel traduccional. Esto sería una regulación a nivel de transcripción y parece que utiliza una vía muy parecida a las epigenéticas tanto canónica como no canónica. Perdona mi tardanza en responderte, pero ando bastante liado.
y existe ahí información sobre enfermedades?
#24 hay indicios de que algunos organismos son capaces de "saltarse" la Crisp.
sera un back up
#17 Yo quisiera, pero no entiendo ni pizca de estas cosas, pero lo poquito que he deducido es que "Por primera vez, el físico Helmut Schiessel y su grupo de investigación proporcionan una fuerte evidencia de que esta segunda capa de información existe en efecto"
es decir, que como señalas, ya se sospechaba y que no, que aún no se ha demostrado científicamente, pero que ahí andan de poder demostrarlo.
Que raro, es la típica noticia que sale cada año, pero suele esperarse para aparecer en verano.
¡Ahora lo entiendo todo!
#26 salio en meneame hace algunos meses, era el sida el que se adaptaba immediatamente? ya no me acuerdo
Confirmado un carajo, primero porque son simulaciones, encima de físicos, y está publicado en un journal de simulaciones físicas, si esto fuese demostrable más allá de una "correlación" estaría en la portada de Nature y Science.
ADN DL
No sé si me he enterado bien. Resumiendo, esta es la cura semanal para el cáncer, ¿no?
#25 Supongo que tendrá que perfeccionarse la técnica, todavía está en "paños menores"
Por otra parte, podrías decirme dónde has leído sobre esos indicios? Me interesa bastante
#54 Jajaja. Que sí hombre que sí. Mándalo a Plos One a ver si te dan el Nobel.
Historial Tor
#5 Gracias, lo he intentado con la traducción automática del chrome y ha sido dramático el resultado.
pero esto de las histonas y la epigenetica es un poco viejo no?
"Tonto el que lo lea"
#34 Nature mete últimamente muchísima morralla (y te la endiñan como contenido gratuito) casi sin corregir. Y como des con un revisor imbécil te puedes morir. El último nos dijo que el inglés no era suficientemente bueno, y estaba redactado por dos nativas. Cuando no te piden que cites al Dr. X 54 veces...
#55 El Nobel, no sé. Pero publicaciones en Nature (Immunology, y Cellular & Molecular Inmmunology) y PNAS llevo unas cuantas ya. Ni Nature es la panacea, ni PLoS One es el Teleprogramas.
#6 No deja de ser una incógnita, pues ahora queda saber de como interviene la posición (forma mecánica) para influir en las ciertas características determinadas e individuales para cada órgano.