Paleontólogo, doctor en Biología por la Universidad Complutense de Madrid, director del MNCN entre 1985 y 1986 y pionero en la paleoantropología y los estudios de los yacimientos de la sierra de Atapuerca (Burgos). Emiliano Aguirre fue el primer director de las excavaciones y mantuvo su puesto de director hasta su jubilación y ha recibido el Premio Príncipe de Asturias en Investigación en 1997.