Pues ahora que Google retira soporte a las Chrome apps, hay que destacar que NW.js soporta Chrome apps y toda las chrome. apis sin hacer ninguna modificación. En cambio con Electron tienes que retocar tu app para hacerla compatible.

Lo malo es que se pierde el modelo de distribución de Google, en el cual el usuario instalaba la app y se olvidaba. Ahora hay que andar con los módulos de autoupdater para Electron (o nw.js), tener un .json online con los detalles de tus versiones, etc...

De no haber retirado soporte Google, las Chrome apps eran una opción bastante cómoda.