Tecomenti

Maravillosas obras de arte. Un amigo me recomendó verlas con un trocolo en mano, pero obviamente no le hice caso para disfrutar de los matices en plenitud de facultades. Aunque no me extrañaría que fuese una experiencia inmersiva de esas que te cambian la vida, a la altura de un Erasmus en Sicilia.

Tecomenti

Noticia que seguramente pase desapercibida pero que es bastante representativa de la política española.

Después de estar la ministra en el CSIC hace 3 días, hoy cesa a su presidenta (por ahora sin ninguna razón más allá de vagos deseos para el futuro). Cambia una investigadora química con amplia trayectoria en materiales y energía, por una doctora en ciencias políticas. Para dirigir el CSIC, los conocimientos en investigación no son tan relevantes como los de administración, así que no tiene nada que ver la formación de ambas en los logros que puedan tener. Aún así, me parece muy ilustrativo el cambio: más política en la ya manoseada ciencia española.

Tecomenti

el entrecomillado del titular no me deja claro si se refiere al busto o a Felipe.

Tecomenti

y a que contenedor va?

ochoceros

#20 Al de resíduos eléctricos, con los ladrones y los enchufes.

robustiano

#20 A uno de éstos por lo menos...

Tecomenti

#49 no es tan fácil. ho en día para procesar esas materias primas, al menos eficientemente, también es necesaria una alta tecnología. Por ejemplo, hoy japón anunció la prohibición de materiales y tecnología a Rusia necesarios para el refinado de petróleo. Puedes tener esas materias primas y morirte igual de frío si no eres capaz de extraerlas o procesarlas. Es una partida muy compleja.

Tecomenti

#26 No solo es "cutre" o de "vagos", es que la Wikipedia puede cambiar (es su principal razón de ser) y lo que citas quizás no exista o esté modificado cuando alguien pretenda consultarlo.

j

#38 En la propia Wikipedia cuando citas una página web se hace constar la fecha en la que lees lo que estás citando.

Tecomenti

#31 Es un punto de vista interesante. En lo personal estoy en contra de la censura de cualquier medio de información, pero quizás porque no me considero muy permeable al mensaje que emiten, extremadamente evidente en el caso de RT o Sputnik (lo que hace que no lo tengo muy en cuenta). La censura de estos medios me parece una acción europea/occidental de cara a la galería, pero no una medida útil. El personaje de Putin, tal y como se ve en el vídeo de YT que enlazo (del 2009) o lo que estamos viendo en estas 2 últimas semanas, me parece que tiene una puesta en escena muy pensada para el target de sociedad al que quiere llegar (rusa/eslava) y que difícilmente puede despertar admiración masiva en otras sociedades europeas. Es más, creo que tiene el efecto contrario en sociedades con otra cultura y no creo que suponga un peligro. Su discurso alternativo no me parece que tenga demasiado recorrido en sociedades como Francia, Alemania, Holanda, Suecia... Veo demasiada distancia cultural para que pueda penetrar. Por ejemplo, de esas entrevistas a Putin con Oliver Stone, solo me pareció convincente su análisis geopolítico, todo lo demás solo me parece interesante para conocer otros puntos de vista pero no comparto absolutamente nada.

Tecomenti

#1 También de Oliver Stone, muy recomendable la serie de entrevistas con Putin del 2017.

https://www.filmaffinity.com/es/film483352.html

Aunque mi documento visual favorito de Putin es este:

D

#29 Tengo la teoría de que es el personaje de Putin el que motiva la censura de los medios rusos, no la información que pueda llegar. Putin es elocuente y conciso, y crea sensaciones muy polarizadas, nadie permanece indiferente como ha sido evidente todo este tiempo. Creo que el temor proviene de que sea esta imagen la que imponga al discurso, y no el que un discurso alternativo sobrepase al discurso oficial.

Tecomenti

#31 Es un punto de vista interesante. En lo personal estoy en contra de la censura de cualquier medio de información, pero quizás porque no me considero muy permeable al mensaje que emiten, extremadamente evidente en el caso de RT o Sputnik (lo que hace que no lo tengo muy en cuenta). La censura de estos medios me parece una acción europea/occidental de cara a la galería, pero no una medida útil. El personaje de Putin, tal y como se ve en el vídeo de YT que enlazo (del 2009) o lo que estamos viendo en estas 2 últimas semanas, me parece que tiene una puesta en escena muy pensada para el target de sociedad al que quiere llegar (rusa/eslava) y que difícilmente puede despertar admiración masiva en otras sociedades europeas. Es más, creo que tiene el efecto contrario en sociedades con otra cultura y no creo que suponga un peligro. Su discurso alternativo no me parece que tenga demasiado recorrido en sociedades como Francia, Alemania, Holanda, Suecia... Veo demasiada distancia cultural para que pueda penetrar. Por ejemplo, de esas entrevistas a Putin con Oliver Stone, solo me pareció convincente su análisis geopolítico, todo lo demás solo me parece interesante para conocer otros puntos de vista pero no comparto absolutamente nada.

Tecomenti

#18 y seguro que morirán muchos que no estan de acuerdo con la invasión. Y seguro que muchos que no estaban de acuerdo con el gobierno ucraniano, pero peor le parece una invasión.

D

#95 Segurisimo, porque no le importan los muertos, ni los suyos ni los otros.

Tecomenti

Me parece bastante significativo que se mencione solo una vez "Rusia" y 10 veces "OTAN". Es curioso enfrentar las alternativas entre OTAN o RUSIA en terminos de antiimperialismo, apoyo de movimientos populares, lucha de clases, contra la corrupcion, el capitalismo y la oligarquia...

Tecomenti

#4 yo soy de los que piensan que es extremadamente difícil que se escapase del laboratorio.

1- para la ganancia de función (tal y como reportan en su estudio), lo deberían hacer con un virus muy similar (99%) y el más similar del laboratorio es 96,4%, que aunque suene similar, es bastante diferente.
2- y el sars-1 y mers? Qué laboratorio tenían cerca? Lo que se suele dar son cuevas cercanas con coronavirus, poblaciones más cercanas a estás cuevas y explotaciones agrícolas todavía más cercanas. Casualidad no es, en eso estoy de acuerdo.
3- precisamente este estudio hablaba de que no requería animal previo para el contagio a humanos. El sars de 2003, se descubrieron los murciélagos en el 2017. Paciencia.
4- puede ser, aunque extremadamente difícil que justo sea un virus nuevo, con ganancia de función de un virus que no se conoce.

Yo no lo descarto, lo califico de extremadamente difícil, pero estas no me parecen evidencias.

m

#11 Como ya he dicho, por si no lo habías leido antes, el covid-1 tiene su especie intermedia y todo lo que se debe tener para justificar su transmisión a humanos sin necesidad de laboratorio. Justo lo que el covid-2 no tiene.
El covid-1 se escapó del laboratorio DESPUÉS de la epidemia, repetidamente. Esto lo cité para que se vea lo fácil que es que suceda.

Tecomenti

#26 ojalá fuese solo eso. Más bien esta para el desvío de fondos y el lobby independentista.

Tecomenti

#25 no. De esos 33k debes descontar la cuota de la patronal por lo que efectivamente el sueldo bruto son 26k, prorrateado en 12 pagas, descuenta la retención de la AEAT y la SS, queda un sueldo de 2k euros netos al mes. Eso si haces 2 años en el extranjero, si te quedas en España es un poco más bajo (seguramente esos 23k que se comentan).

Tecomenti

#12 igual que las fábricas u otras empresas, funcionan gracias a sus trabajadores (en función de su grado de responsabilidad), no a los dueños.

Tecomenti

#235 epidemologos no, pero sin unos cuantos virologos, fisicos, quimicos, biologos y un largo etcetera de profesionales que se dedican al diseno de farmacos. Entre los cuales me incluyo y con los cuales sigo trabajando.

Puede que muchos profesionales se presenten escepticos, pero no representan ni una mayoria, ni siquiera una cantidad considerable, y muchas de esas dudas escepticas van acompanadas, como apunte antes, a una decoracion interesada por parte de los medios. Habra muchos profesionales que plantean dudas, pero tambien me he encontrado con muchas de esas dudas publicadas de una forma totalmente sesgada tras pasar el filtro de los medios. Todas estas dudas son planteadas en declaraciones, no hay ninguna publicacion cientifica, NI UNA, que plantee serias dudas sobre la eficacia de las vacunas o la seguridad de las mismas.

Dicho esto, no hay ninguna publicacion cientifica que arroge un numero significativo de efectos secundarios entre los mas de 4000 millones de dosis. Un caso reportado de cada millon de vacunas [1]. Otros articulos muestran menos del 0.001% tienen efectos secundarios despues de 4 dias [2], con una clasificacion de cada tipo de efecto secundario.

Entre un 50% y un 96% de eficacia tiene la vacuna [3]. Los motivos de la baja eficacia vienen desglosados en el articulo, que dependen de factores sociales, personales, cepa del virus, etc...

Ejemplos practicos si que sobran de la eficacia de la vacuna, en todos los paises a disminuido el ingreso hospitalario en correlacion con la fecha de vacunacion de esa franja de edad. Incluso en grupos que no son de riesgo se ha dado el caso, por ejemplo, como indica en la referencia [3], un 82% de reduccion en trabajadores del sistema sanitario de estados unidos entre los vacunados vs no vacunados.

El argumento ese es una chorrada que no se sostiene. Si tantos datos tiene, que lo publique. Por ahora solo publica estadisticas del efecto del coronavirus en la poblacion, nada sobre la vacuna.

[1] https://bmcmedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12916-021-02059-5
[2] https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.27214
[3] https://www.nature.com/articles/s41577-021-00592-1

Tecomenti

#150 yo no sé cómo no te sientes ridículo citando a “uno de los epidemiólogos más importantes de Islandia”, ojo! De Islandia! Además que no es cierto, tiene el doctorado desde 2013 en virología pediátrica. Si ves sus publicaciones verás que es completamente irrelevante hasta que llegó el coronavirus y tiene artículos de estadísticas porque es el “Fernando Simón” islandés. Además, más allá de ese detalle, son unas declaraciones y no están fundamentada en ningún experimento. No pertenece a ninguna revista revisada por pares donde, ahí sí, están publicando de los mejores científicos del mundo prácticamente cada semana. Ayer mismo en Nature se publicó un artículo muy interesante sobre la eficiencia de Pfizer y las variantes, escrito por científicos del Imperial College. Con datos, matemáticas y reproducible para aquel que siga su método. No son unas declaraciones de su creencia… que además seguramente estén adornadas por el periodista de turno. Igual ni quiso decir eso, simplemente lo planteó como una posibilidad. Pero ya acaba de ser proclamado como una eminencia.

Sobre los efectos secundarios también hay artículos de sobra que reducen esa estadística a menos que anecdótica. A estas alturas, con la cantidad de vacunados que hay, plantear esas dudas apocalípticas es irrisorio.

“menos comun como tu bien dices pero ocurre mucho mas de lo que deberia”, esta frase es increíble. ¿Cuanto debería una vacuna, según tus conocimientos, disminuir la hospitalización?

oriol

#232 Has esuchado hablar de algun epidemiologo antes de la epidemia tu?
Hay muchos mas profesionales del sector que son muy escepticos, ademas tienes delante los ojos los resultados que hay. Tu argumento de anecdotica te lo puedo devolver a ti, igual que el argumento de los periodistas, esta muy claro lo que dice el señor, vacunad quien lo necesite, no a todo el mundo, vacunar a todo el mundo es una batalla perdida y tienes los resultados delante tu cara con una vacuna que no funciona como deberia. Ademas de eso y tienes ejemplos practicos de sitios del mundo donde se ha confinado y donde no y sus resultados.

Tecomenti

#235 epidemologos no, pero sin unos cuantos virologos, fisicos, quimicos, biologos y un largo etcetera de profesionales que se dedican al diseno de farmacos. Entre los cuales me incluyo y con los cuales sigo trabajando.

Puede que muchos profesionales se presenten escepticos, pero no representan ni una mayoria, ni siquiera una cantidad considerable, y muchas de esas dudas escepticas van acompanadas, como apunte antes, a una decoracion interesada por parte de los medios. Habra muchos profesionales que plantean dudas, pero tambien me he encontrado con muchas de esas dudas publicadas de una forma totalmente sesgada tras pasar el filtro de los medios. Todas estas dudas son planteadas en declaraciones, no hay ninguna publicacion cientifica, NI UNA, que plantee serias dudas sobre la eficacia de las vacunas o la seguridad de las mismas.

Dicho esto, no hay ninguna publicacion cientifica que arroge un numero significativo de efectos secundarios entre los mas de 4000 millones de dosis. Un caso reportado de cada millon de vacunas [1]. Otros articulos muestran menos del 0.001% tienen efectos secundarios despues de 4 dias [2], con una clasificacion de cada tipo de efecto secundario.

Entre un 50% y un 96% de eficacia tiene la vacuna [3]. Los motivos de la baja eficacia vienen desglosados en el articulo, que dependen de factores sociales, personales, cepa del virus, etc...

Ejemplos practicos si que sobran de la eficacia de la vacuna, en todos los paises a disminuido el ingreso hospitalario en correlacion con la fecha de vacunacion de esa franja de edad. Incluso en grupos que no son de riesgo se ha dado el caso, por ejemplo, como indica en la referencia [3], un 82% de reduccion en trabajadores del sistema sanitario de estados unidos entre los vacunados vs no vacunados.

El argumento ese es una chorrada que no se sostiene. Si tantos datos tiene, que lo publique. Por ahora solo publica estadisticas del efecto del coronavirus en la poblacion, nada sobre la vacuna.

[1] https://bmcmedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12916-021-02059-5
[2] https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.27214
[3] https://www.nature.com/articles/s41577-021-00592-1

Tecomenti

#8 Documental de Herzog, un Dios. Vale la pena toda su filmografía.

Tecomenti

#132 Si de verdad vas a Noruega o cualquier otro país, excepto en pueblos muy muy pequeños, verás que hay chinos, japoneses, lesbianas, negros, gordos, flacos... al principio no te imaginas que un negro o asiático son noruegos, pero en cuanto socialices un poco y más de uno te ponga en tu sitio con buenas y serias palabras (y te lo digo por experiencia, que nadie nace aprendido), puede que reconozcas por la vía rápida que los estereotipos esos que tienes en la cabeza si que son de película.

R

#137 claro y en Barcelona. Eso no es lo que se está discutiendo.

Yo no tengo esterotipos trabajo con chinos, japoneses, rusos, brasileños, ingleses, africanos, gente del Líbano... y hasta los jefes son negros. Una cosa no quita la otra.

El único que tiene estereotipos de hecho eres tu, que no estás leyendo ni entendiendo lo que digo porque ni escuchas. No solo eso si no que niegas la realidad, que tu mismo lo dices... En las capitales hay de todo, ya en las zonas lejos de los turistas la cosa cambia.

Tecomenti

#64 si te lo preguntas solo por el color de piel si me parece una idea racista. Tiene apellidos gallegos, acento gallego… seguro que esas preguntas no surgen con Álvarez de Toledo, Rocio Monasterio o Ortega Smith.

Quizás no sea malintencionado y bastará con una breve explicación, pero esa fase donde los “negritos” nacen en África debería estar superada. O la irrisoria idea de que los españoles son blancos.

Psignac

#82 Perdona pero eso es una estupidez. Mi primo, que es andaluz, tiene el pelo rubio y los ojos grises y yo a veces me pregunto si le vendrán los genes de los alemanes que trajo Carlos V hace 500 años. ¿También es eso racista? No hay nada racista per sé en preguntarse sobre los orígenes de alguien que se sale de lo frecuente físicamente en la zona. Lo racista sería discriminar por esa razón.

l

#121 Parece que el racismo solo es patrimonio de blancos pero cuantos mas pobre la zona mas xenofobia. Los hutus y tutsis no se podian tratar, y en la india estan las castas.

creo que dentro del colectovo LGBT Tambien hay discriminaciones.
https://noticieros.televisa.com/especiales/lo-que-es-bisexual-y-discriminacion-que-viven/
#62 Es pura inferencia estadistica, si es negro es mas problable que no sea España, pero en este caso no lo es.
#64 Yo he tenido 2 0 3 profesoras de ingles que tenian mucha pinta de inglesas a alguna se lo prguntabamos porque lo dudabamos.
Unaera rubia y muy blanca, otra morena pero tenia pinta y otra tenia el estlo de vestir un poco ingles.

#118 Tambien vinieron muchos ingleses por las minas de Rio tinto. Hay andaluces con mucha pinta de ingles.

Del todo es machismo es facil adoptar el todo es racismo, como los conguitos o pintarse de negro.
#22 Aporofobia

#51 Estaria bien saber la sociologia de las zonas, porque en algunas son mas de "vive y deja vivir" que otras.

Tecomenti

#29 esa idea de que no es la típica española por tener un padre de origen extranjero es muy parecida a lo que aplicaban los nazis estableciendo distintos rangos dependiendo si eras alemán puro, mixto de primera generación, de segunda, etc…

https://es.m.wikipedia.org/wiki/Leyes_de_Núremberg

A mi esa distinción me parece racista, injusto y arcaico para el mundo que vivimos. Soy de un pueblo que está a 20 minutos del de Ana Peleteiro y, pese a ser yo mayor, he vivido menos años en España que ella. A mi nadie me cuestionaría la nacionalidad y eso que tengo muy poco apego hacia ella.

R

#50 yo tampoco le cuestiono la nacionalidad, pero es que si te vas a Noruega esperas rubias, si ves alguien negro no imaginas que sea noruego, incluso si te habla en su idioma.

No todo son películas de Hollywood donde hay un chino, un japo, una lesbiana, un negro, un gordo, un flaco, y una mujer alpha en todos los repartos para evitar denuncias y las quejas de los wokes.

Sobre la noticia, tampoco tienen que decirle nada a la chavala o gritarle, una cosa no quita la otra.

Tecomenti

#132 Si de verdad vas a Noruega o cualquier otro país, excepto en pueblos muy muy pequeños, verás que hay chinos, japoneses, lesbianas, negros, gordos, flacos... al principio no te imaginas que un negro o asiático son noruegos, pero en cuanto socialices un poco y más de uno te ponga en tu sitio con buenas y serias palabras (y te lo digo por experiencia, que nadie nace aprendido), puede que reconozcas por la vía rápida que los estereotipos esos que tienes en la cabeza si que son de película.

R

#137 claro y en Barcelona. Eso no es lo que se está discutiendo.

Yo no tengo esterotipos trabajo con chinos, japoneses, rusos, brasileños, ingleses, africanos, gente del Líbano... y hasta los jefes son negros. Una cosa no quita la otra.

El único que tiene estereotipos de hecho eres tu, que no estás leyendo ni entendiendo lo que digo porque ni escuchas. No solo eso si no que niegas la realidad, que tu mismo lo dices... En las capitales hay de todo, ya en las zonas lejos de los turistas la cosa cambia.

Cuñado

#132 Es que si fueses a California te cruzarías con mucha gente a la que tú identificas como "chinos" o "japos" y que son tan estadounidenses como Trump.

Es más, allí los blancos no hispanos (a los que por supuesto corresponde legítimamente el papel protagonista, más faltaba) ni siquiera son mayoría.

Pero eso sí, tú no eres racista pero... si los protagonistas no son blancos (los "chinos" y negros en papeles secundarios nunca llamaron la atención de la carcundia) es para evitar las quejas de los wokes

R

#144 no he ido a California puede que sea verdad lo que dices o que te lo hayas inventado. Pero sí he ido a Denmark y otros países Europeos donde se cumple la norma.

Por tanto mi ejemplo es tan o más válido que el tuyo. No puedes extrapolar un caso general a la mayoría.

Si es que da pena la gente que es tan inocente ¿Que crees que serías tu en Japón, un Nipón como cualquiera? Si aparecieras allí ahora mismo - solo culturalmente - ya les apestarias allí.

Cuñado

#152 Ya, bueno... pero es que Hollywood está en California, no en Denmark. Supongo que también pensarás que las películas de Bollywood están llenas de indios para evitar las quejas de los wokes

¿Que crees que serías tu en Japón, un Nipón como cualquiera?

No, en Japón sería un extranjero aunque hubiese nacido allí. Es un país incluso más racista que EEUU y a la gente normal, que desprecia el supremacismo racial, les reservan calificativos incluso peores que el woke estadounidense que con tanto gusto ha acogido la carcundia patria.

Pero, concretamente... ¿eso qué tiene que ver con mi comentario y, sobre todo, con el tuyo?

R

#159 vaya así que tu eres el que reparte carnets de racista. Has vivido en Japón en los últimos 20 años?

Cuñado

Del creador de Si aparecieras allí ahora mismo - solo culturalmente - ya les apestarias allí., ahora en sus pantallas... #161 vaya así que tu eres el que reparte carnets de racista lol

Tecomenti

#86 Entiendo su posición, aunque siguiendo su analogía: tanto el proceso de vacunación como la BBDD es solo una cuestión de recursos materiales. Científicamente me parece solo relevante a nivel de aplicabilidad (aunque el caso de la BBDD va tener seguro mas repercusiones. Ya las esta teniendo en ciertos casos especiales).

Muy a mi pesar, RoseTTaFold todavía no obtiene los resultados de AlphaFold2. Lo cual no quita que ha sido un gran trabajo de la comunidad de Rosetta. Puedes leer el artículo aquí (Figura 1.b):

https://science.sciencemag.org/content/early/2021/07/19/science.abj8754

h

#88 Pues precisamente, para ser, como tú dices, solo una cuestión de recursos materiales, no entiendo la grandilocuencia del titular y el tono general del artículo, de ahí mi confusión. Y repito, publicar la BBDD me parece un gran segundo paso.

Lo de que RoseTTaFold todavía no obtiene los resultados de AlphaFold2, pues depende como lo mires: sus métodos heuristicos ya juegan en la misma liga que AlphaFold, pero con muchos menos recursos computacionales. Tal como dicen ellos en el artículo que enlazas:

The performance of the three-track model on the CASP14 targets was still not as good as AlphaFold2 (Fig. 1B). This could reflect hardware limitations that limited the size of the models we could explore, alternative architectures or loss formulations, or more intensive use of the network for inference. DeepMind reported using several GPUs for days to make individual predictions, whereas our predictions are made in a single pass through the network in the same manner that would be used for a server; following sequence and template search (~1.5 hours), the end-to-end version of RoseTTAFold requires ~10 min on an RTX2080 GPU to generate backbone coordinates for proteins with less than 400 residues, and the pyRosetta version requires 5 min for network calculations on a single RTX2080 GPU and an hour for all-atom structure generation with 15 CPU cores.

Es decir, consiguen resultados que están en el mismo orden de magnitud que los de AlphaFold, pero en un par de horas en vez de en varios días. Más abajo dice:

We expect the end-to-end approach to ultimately be at least as accurate [as AlphaFold] once the computer hardware limitations are overcome, and side chains are incorporated.

Y yo, con los datos que tengo, me lo creo. Técnicamente, con los datos que tenemos, tanto AlphaFold como RoseTTAFold son soluciones Pareto-óptimas en el espacio recursos vs precisión. Me gustará ver a RoseTTAFold correr sobre un hardware tan potente como el que usó AlphaFold.

Tecomenti

#1 #4 #20 por si os interesa, en esta noticia de hace unos meses comenté algunos detalles de lo que supone computacionalmente este logro (y donde ya intuía que se vería una base de datos de sus resultados porque realmente son impresionantes y era un paso lógico)

AlphaFold: una solución a un gran reto de 50 años en biología [ENG]

Hace 3 años | Por ccguy a deepmind.com

Tecomenti

#20 no y si. Lo interesante no es la base de datos, es el algoritmo AlphaFold que es capaz de predecir la forma tridimensional de una proteína en segundos/pocos minutos. Existe desde hace años técnicas muy sencillas para secuenciar proteínas (obtener la secuencia de aminoácidos), pero obtener la estructura era lento, caro y tedioso, necesitando de cristalografía de rayos x o cryoEM. Cómo consecuencia, tenemos un gap entre los cientos de miles de secuencias de las que sólo sabes unos miles de sus correspondientes estructuras. Dado que la estructura tridimensional es la que determina su función, es esencial entender esta para comprender las funciones de las proteínas y cómo podríamos diseñar proteínas inexistentes en la naturaleza (secuencias que no se han dado en la evolución) para conseguir la función que deseamos, es decir, crear medicamentos ad hoc.

Este algoritmo, dada su rapidez y precisión (esencial), va permitir reducir ese gap en un tiempo más que razonable y con una precisión realmente destacable. Cuando antes los algoritmos tardaban entre semanas y meses (y con una estocasticidad nada desdeñable), ahora lo obtenemos en minutos. Cuando antes obteníamos una precisión de (digamos) un 70%, este arroja resultados por encima de 90.

Disclaimer: en realidad no es una correlación lineal, no se mide en porcentaje la correlación entre la estructura predicha y la conocida de benchmark (obtenida, por ejemplo, con rayos x). Lo digo por simplificar. Pero a partir de, digamos, el 80%, era sumamente difícil mejorar. Esto es un petardazo.

h

#54 Que sí, que AlphaFold es superchachi, estoy de acuerdo, pero ya no es la noticia de actualidad... a ver si me explico: AlphaFold es a la BBDD (copio del artículo: DeepMind y el Laboratorio Europeo de Biología Molecular han publicado este jueves más de 350.000 estructuras) lo que la vacuna de Pfizer es al proceso de vacunación contra el COVID: son los precursores, pero ya no son la noticia. Es como si mañana aparece una noticia en portada diciendo que "Pfizer ha conseguido crear una vacuna con una efectividad del 90% contra la COVID" y todos nos maravillamos... pues sí, es una maravilla, pero ¿estabas debajo de una piedra o que? A día de hoy la noticia es cómo va el proceso de vacunación.

Por cierto, del artículo: Con AlphaFold puedes tener una predicción con un 58% de fiabilidad.
Por otro lado, hace unos días mandé esta otra noticia que sí se trata de un nuevo algoritmo para lo mismo que hace AlphaFold, pero mejor, y no tuvo tanto éxito como esta, aquí la dejo: RoseTTAFold iguala a AlphaFold2 de DeepMind [ENG]

Hace 2 años | Por hazuko a cen.acs.org

Tecomenti

#86 Entiendo su posición, aunque siguiendo su analogía: tanto el proceso de vacunación como la BBDD es solo una cuestión de recursos materiales. Científicamente me parece solo relevante a nivel de aplicabilidad (aunque el caso de la BBDD va tener seguro mas repercusiones. Ya las esta teniendo en ciertos casos especiales).

Muy a mi pesar, RoseTTaFold todavía no obtiene los resultados de AlphaFold2. Lo cual no quita que ha sido un gran trabajo de la comunidad de Rosetta. Puedes leer el artículo aquí (Figura 1.b):

https://science.sciencemag.org/content/early/2021/07/19/science.abj8754

h

#88 Pues precisamente, para ser, como tú dices, solo una cuestión de recursos materiales, no entiendo la grandilocuencia del titular y el tono general del artículo, de ahí mi confusión. Y repito, publicar la BBDD me parece un gran segundo paso.

Lo de que RoseTTaFold todavía no obtiene los resultados de AlphaFold2, pues depende como lo mires: sus métodos heuristicos ya juegan en la misma liga que AlphaFold, pero con muchos menos recursos computacionales. Tal como dicen ellos en el artículo que enlazas:

The performance of the three-track model on the CASP14 targets was still not as good as AlphaFold2 (Fig. 1B). This could reflect hardware limitations that limited the size of the models we could explore, alternative architectures or loss formulations, or more intensive use of the network for inference. DeepMind reported using several GPUs for days to make individual predictions, whereas our predictions are made in a single pass through the network in the same manner that would be used for a server; following sequence and template search (~1.5 hours), the end-to-end version of RoseTTAFold requires ~10 min on an RTX2080 GPU to generate backbone coordinates for proteins with less than 400 residues, and the pyRosetta version requires 5 min for network calculations on a single RTX2080 GPU and an hour for all-atom structure generation with 15 CPU cores.

Es decir, consiguen resultados que están en el mismo orden de magnitud que los de AlphaFold, pero en un par de horas en vez de en varios días. Más abajo dice:

We expect the end-to-end approach to ultimately be at least as accurate [as AlphaFold] once the computer hardware limitations are overcome, and side chains are incorporated.

Y yo, con los datos que tengo, me lo creo. Técnicamente, con los datos que tenemos, tanto AlphaFold como RoseTTAFold son soluciones Pareto-óptimas en el espacio recursos vs precisión. Me gustará ver a RoseTTAFold correr sobre un hardware tan potente como el que usó AlphaFold.

Tecomenti

#14 es el último autor porque es el investigador principal de su laboratorio. Si buscas su nombre en Google puedes ver que tiene un CV espectacular para la edad que tiene.

C

#18 Investigador, y modesto.

leitzaran

#21 Modesto no, César.

kaostias

#18 Y ya en el mismo artículo dice: "Hace poco más de un año fue designado como Mejor Investigador Joven en enfermedades infecciosas de EEUU por la American Chemical Society y recientemente ha recibido el premio de Investigación Científica 2021 de la Fundación Princesa de Girona"